卫生局表示，局方正设计健康评估问卷，向在湖北的澳门居民了解其健康状况，例如过去14日有否到当地的医院、有否与确诊病人接触，以及有否出现发烧、咳嗽、咽痛、全身乏力、肌肉酸痛、腹泻等症状，由局方从中评估他们是否适合上机。
同时，于包机飞抵湖北当天，医护人员亦会在机场内设置检查点，为他们作身体检查，再明确他们有否患病和是否有条件上机。
当局为有意回澳的居民做了一些评估，包括47人都持有澳门居民身份证，当中的18岁以下人士，其中一些有成年的家人陪同回澳，另一些在本澳亦有监护人。该47人基本符合由旅游局方面评估的登机条件。同时，47人当中有3岁以下的澳门儿童，也有早前传媒关注到的一名澳门婴儿。