溶菌酶Lysozyme在聚四氟乙烯表面的三維構像
澳门大学最近在生物芯片发展研究再有突破，成功设计出有效预测蛋白质表面吸附结构的智慧型计算方法，有助研发以蛋白质为配体的生物微型芯片。该研究获相关领域中最权威的牛津大学出版社期刊《Bioinformatics》刊登。 该项研究由澳大科技学院生物信息学实验室与模拟与混合信号超大规模集成电路国家重点实验室进行，成功开发出以智慧型计算为本的算法，解决了蛋白质吸附在固体表面上的三维结构预测中构像取样的问题。该算法灵感来自於大自然，建基於鸟群觅食的社会行为模式：鸟儿记住见过最多食物的地方，亦透过互相通讯来更新鸟群所知的最佳食物来源，透过这些资讯，他们会反复调整飞行的方向以朝著认为比较可行的地方前进，直到没有找到更好的食物源为止。 澳大研究员结合上述搜索模式与描述蛋白质表面相互作用能量的函数，建立了一个有效的蛋白质表面吸附结构预测计算机算法。透过优化蛋白质构像的预测，研究员便可从所有可能的表面位置和蛋白质的吸附方向中，搜索出最低能量的蛋白质三维构像。相关程式更与最流行的分子模拟软件合作无缝（详见於网站http://cbbio.cis.umac.mo/software/protpos/），使预测的结果可立即用作进一步生物芯片设计中的计算研究。 该项研究由澳大博士生倪载丰进行，助理教授萧咏然和副教授麦沛然共同指导， 并由澳门大学资助。