审计署公布《轻轨系统─第四阶段》专项审计报告，披露轻轨系统截至2017年12月，只完成了氹仔线9.3公里的土建工程，占轻轨一期建设规模的44.28%，而澳门线则只开展了妈阁站的前期工作。至2016年底，运建办对轻轨系统重新规划，订定了短、中、远期共11条走线。原轻轨一期的氹仔线及澳门线分别被安排为短期及中期规划。然而，除了短期规划的5条走线预计最早於2026年完成外，其余中及远期规划走线未有订定任何完成时间。
在投资成本上，轻轨一期由2007年预计的42亿澳门元建设成本，大幅增加至2012年9月的142.73亿澳门元。2016年5月，运建办以澳门线仍未落实具体走线为由，未有再更新澳门线的估算。此外，2016年订定短、中、远期11条走线时，运建办亦没有就每一条走线或整个项目订定任何造价资料。及至2017年12月，整理各走线的资料，有3条走线未有任何估算，而其余8条走线亦只有氹仔线有进行更新，估算金额为108.23亿澳门元。此外，截至2017年12月31日，轻轨系统累计总判给金额约为132.73亿澳门元，当中有3个主要的合同曾作合同修改或解除合同，涉及的额外开支及损失总金额约为17.26亿澳门元。
筹备氹仔线的营运方面，於2016年6月首次披露运建办将於2017年转为以公司方式筹备轻轨运营，但至2018年7月有关公司仍未能成立。此外，於2018年4月，运建办以58.86亿澳门元外判氹仔线的“营运及维护服务”，以提供氹仔线通车前各项准备工作以及首五年营运及维修保养列车等服务。
是次跟踪审计的主要发现是氹仔线3个工程分段於动工后曾多次获批准延长工期，延长的工期日数占原工期的95%至111%不等。审计署从氹仔线3个工程分段的延长工期申请中，抽取延期日数较多的里程碑为个案进行探讨，当中发现运建办在延期申请的审批分析工作以及协调管理工作方面存在严重缺失。对於可引致延期的事件，工程业界国际标准重视作出预先警告，及要求承建商於知悉事件后的28日之内作出通报，而工程业界的一般做法可以更为严格。至於本澳法例以及轻轨承揽规则亦有相关规定，要求承揽人在知悉事件发生后5日内通知定作人。有关做法有利於掌握当时实际情况避免日后争拗，亦可即时管控问题避免造成不可逆转的事实。然而，运建办对此未有重视，报告揭露其一宗个案，因交通指示牌阻碍施工，承建商在超过6个月后才作出通报，最后更发现只需要使用一台较小机器便可解决，可见倘能及早处理絶对可减低对工程进度的影响甚或无需延期。
报告又反映运建办没有就延期的分析审批妥善把关，在一宗关於有关横琴线接驳位欠缺桥墩及底部结构设计的个案中，按推断影响施工的时间应该大约在2013年4月，但运建办在未有详细说明之下，却批准影响日期由2012年10月开始计算，增加了获批准的延期日数。此外，运建办的延期分析审批结果亦令人质疑，当中未有提及发给承建商的警告信所反映的承建商投入人力不足、管理混乱等问题。
在前期协调管理方面，在一宗关於被另一项公共工程的临时办公室占据了轻轨施工场地的个案中，运建办仅在动工4个月后才发公函予有关部门正式要求迁离，最终导致相关的里程碑延误近一年。而在场地明显受阻不具条件移交下仍签署动工笔录交场，其后又因场地移交问题批准延期申请，反映运建办在工程动工前未有积极进行协调。
审计署透过综合评论指出，根据运建办在2009年公布的《澳门轻轨系统第一期2009兴建方案》，当时的目标明确表明建设车站总数21个，路线总长21公里，预计2014年投入运作。截至2018年8月，澳门轻轨系统只能预计氹仔线在2019年通车，整项工程的执行情况，包括路线设定、造价预算、工程管理、竣工时间，皆与当初的计划存在巨大落差。
透过今次审计所揭示的问题，审计署促请工务部门今后在所有公共工程方面都需针对过去长期存在的不足，加强工期管理机制的构建与落实。若公共部门自己不重视延期申请管控及违约金的实施，则承建商在投标前会产生不必依法执行的期望，也不会认真考量自身能力与估算成本，正因为从协调部门开始一环扣一环的失误、延期、有法不依、有错不罚，不遵循国际惯常的大型公共工程监控及管理方式行事，令轻轨系统的工程一拖再拖，一错再错，工程投资与工期都完全无法控制在当初所批准的计划内。
综合四次跟踪审计所反映的情况，运建办至今仍无法明确计算出整体工程的造价，且倾向以“边做边改”、“判给后才公布造价”的方式，营造“没有超支”的表面现象。审计署引述国际谘询工程师联合会的《采购程序指引》，评估一个项目是否在经济上可行，需要具备切合实际的估算。优化公共工程的招标程序，提高重大工程的透明度，是落实施政目标的最基本要求。
审计报告指出，运建办应加大力度认真履行法定的职责，在轻轨系统迈向下一阶段之际，把握最好的时机，进行中期检讨，参考国际大型工程行之有效的方法计算出造价，负责任地做好整体规划，为轻轨工程的未来跟进方式及科学决策提供更全面的资料和理据，开诚布公地解释社会各界提出的质疑和忧虑，切实吸取教训，为下一阶段的工作制定合乎常理的计划，并追回配合特区整体交通政策的进度。此外，所有工务部门都应该以轻轨工程所出现的各种问题为借鉴，认真检视公共工程的不足，杜绝类似问题再发生，挽回公众的信心。
报告较早前已呈送行政长官，公众可於审计署网站(http://www.ca.gov.mo)下载报告全文，或於办公时间到审计署免费索阅。