作为本澳首个轨道交通建设项目，轻轨系统项目对本澳技术人员及政府而言皆是一项新事物，无论在技术、预算、管理、监控，以致法律等方面在澳门皆无先例可循。政府在推进项目的过程中，尤其在落实和展开工程的初期，一直面对不少的困难和挑战；氹仔线的施工更出现迟缓以及车厂停工等问题。
本届政府上任后，经综合各现实情况作出考量后，对项目的目标及发展方向作出调整，订立2019年氹仔线通车的目标，并按实际情况订出短中长期的线路发展规划。政府积极采取措施，实事求是，理顺氹仔线的各种问题，并解决车厂的纠纷，令氹仔线建设逐步回到正轨，全力朝2019年通车的目标迈进。与此同时，政府亦积极检视并不断完善新开展工程的合同及承揽规则条文，加强对工程项目的监管，确保新开展的工程合同能按时按质完成。而事实上，近年轻轨项目新开展工程的施工进度及开支情况，亦基本符合相关合同的要求。
在财务管理方面，综观国际及邻近地区的经验，轨道交通项目多以单一线路作为财务评估及管理的基础；澳门轻轨项目已订出短中长期的线网发展规划，在目前的规划中，大部份线路仍然处於研究和探讨阶段，尚未有确实之走线建设方案及落实建设的时间表，故政府不具备条件开展落实建设的财务预算。基此，不宜将不同基础的财务预测累加作为整个项目的造价开支，而以单一线路为基础开展造价估算更能配合预算的监控及财务管理工作。政府於2016年公布氹仔线造价估算为110亿澳门元及於2019年完成的资讯，至今仍在控制之内，将於短期内公布氹仔线连接妈阁以及石排湾线的造价估算及预计工程期。
运输基建办公室感谢审计署对“轻轨系统项目”所展开的跟踪审计工作，作为负责建设轻轨系统的技术部门，运建办会持续审视自身工作并作出优化，力求做好各项建设工作，及早为居民提供便捷、安全和可靠的集体运输服务。