就内地武汉市出现不明原因肺炎群集病例的情况，卫生局已接获国家卫生健康委员会的通报，2019年12月以来，湖北省武汉市开展呼吸道疾病及相关疾病监测，发现不明原因的病毒性肺炎病例，病例临床表现主要为发热，少数病人呼吸困难，胸片呈双肺浸润性病灶。截至2020年1月3日8时，共发现符合不明原因的病毒性肺炎诊断患者44例，其中重症11例，其余患者生命体征总体稳定。目前所有病例均在武汉市医疗机构接受隔离治疗，已经追踪到121名密切接触者并行医学观察，密切接触者的追踪工作仍在进行中。流行病学调查显示，部分病例为武汉市华南海鲜城经营户。截至目前，初步调查表明，未发现明显的人传人证据，未发现医务人员感染。病原鉴定（包括核酸检测和病毒分离培养）和病因溯源工作正在进行中，已排除流感、禽流感、腺病毒感染等常见呼吸道疾病。
就上述情况卫生局表示十分关注，武汉相关不明原因病毒性肺炎多达44例，而其中11例（25%）病情严重，仍是不寻常的情况，且目前病因仍未明确。卫生局会与国家卫生健康委员会保持密切联系，做好各项应对突发传染病的准备，持续对医务人员提供感染控制和发现各种传染的培训，并有充分的药物、其他消耗性物质、设施设备等的储备。卫生局已加派人手加强在各口岸尤其机场的卫生检疫措施，并从1日起已在澳门国际机场对来自武汉航班的乘客进行体温筛查，为加强监测旅客健康状况；于2日起并要求来自武汉航班的乘客填写健康申报表，相关措施采取至今未在有关乘客中发现发热病；而其他航班和其他口岸亦暂时未发现有曾在武汉逗留而发热的病人。有关措施仍会持续。
自昨（2）日至今（3）日下午5时，澳门仅在科大医院接获1名71岁女性武汉游客出现不适的报告，患者于去年12月24日由武汉来珠海，30日到澳门；于1月2日出现发热及咳嗽症状，经检查后证实为急性支气管炎，病情一般，无肺炎表现。
另外，就有消息称金沙城中心有1名旅客发热多天不愿前往医院就诊一事，卫生局表示，根据金沙城中心医疗室的报告，有1名来自武汉的旅客于1月1日晚因发热到医务室就诊，当时并无肺炎征状，中心医生于1月2日再次跟进患者情况时已退热，并在随后离开澳门。金沙城中心报告近日亦没有如传言中称有员工患肺炎的情况。
而就有社交媒体传言称：〝卫生局发出的通知：这次的流感很严重… …〞，卫生局澄清，有关消息并非卫生局发出，虽目前本澳已进入流感季节，但疫情尚算平稳，建议未接种的人士尽快接种，注意各项个人和环境卫生措施来预防流感；并呼吁巿民不要转发或相信未经证实的消息。卫生局的消息会通过政府新闻局、卫生局网页或官方微信等渠道发放。
卫生局亦再次提醒前线医务人员保持警惕，若发现可疑病例应及时通报，采取相应的感染控制措施，包括：如在口岸或医疗机构内发现发病前14日内曾在武汉逗留的发热、呼吸道症状病人，会作进一步详细检查；并呼吁居民毋须恐慌，但要注意个人卫生和环境卫生，到武汉或其他地方旅行时，避免接触禽鸟和其他动物；往人多拥挤的地方前可考虑配戴口罩；避免到当地医院或接触当地患病的人士；外游回澳后，如有不适，应及早就医，并向医生详述旅行史。如有疑问，请致电卫生局传染病热线，电话28700800。