应变协调中心介绍口罩使用后的处理方式。在一般情况下，任何人都要先洗手再脱下口罩，并避免触摸到口罩的外层，丢弃口罩于有盖垃圾筒内，之后应再次洗手。
若为高风险人士，如疑似病人和密切接触者等，在医院内会将用完的口罩丢弃在装有黄色垃圾袋的垃圾筒内，这视为具传染性的医疗废弃物，因此会作后续的严格处理，以免污染环境。至于中风险人士（有一般不适情况），应先将用完的口罩装入袋内，再丢弃到垃圾筒。而一般人使用过的口罩则丢弃于有盖垃圾筒内便可。
协调中心又指，新冠病毒对紫外线和热敏感，一般在摄氏56度持续逾30分钟便可使病毒灭活。本澳的垃圾一般以焚化方式处理，而焚化温度达到摄氏800度，足够控制有关的风险。