新型冠状病毒感染应变协调中心经参考世界各地的做法，决定由即日起，只公布和疫苗接种有潜在关系的严重不良事件包括死亡事件，对有明显的医学原因能解释成因的包括死亡在内的不良事件，则只作为新冠病毒疫苖接种后不良事件评估工作小组监测分析用途，若出现不寻常的增加，才会作出公布。
按照世界卫生组织定义，疫苗接种后不良事件指的是注射疫苗后，发生任何对健康造成负面影响的事件，这些事件有时序相关（接种“后”发生），但不一定存在着因果关联性。接种后不良事件，分别为由疫苗引起（例如接种疫苗后的红肿热痛、过敏反应等）、焦虑等心理因素反应引起（与疫苗本身性质无关）、偶合事件（注射疫苗后刚巧出现其他疾病，即使不注射疫苗也会发生）、疫苗生产或使用程序错误，如疫苗制作、运输、储存过程或接种过程失误（与疫苗本身性质无关）、不确定性或需经过专家分析寻找原因的个案。
应变协调中心强调，接种后出现不良事件不等于疫苗的副作用，两者是不一样的，在专家未能判断事件与疫苗有因果关系之前，不能贸然判断事件由疫苗引起。而且疫苗上市使用时会建立一个监测系统观察。世界卫生组织对此亦有一套严谨程序和标准，包括事件的一致性、相关强度、特异性、时间相关性、生物合理性等。
因应新型冠状病毒疫苗接种的开展，卫生局成立了新冠病毒疫苖接种后不良事件评估工作小组，由多个医疗专业范畴代表组成，当有接种者出现严重不良事件后，会分析及作出评估其因果关系，以加强澳门接种新型冠状病毒疫苗的监测和跟进工作。
截至2021年6月9日，全球已接种各种类型新冠疫苗超过21亿剂。自2020年12月世界各地开始大规模接种疫苗以来，世界各地的卫生机构均密切监测新冠疫苗接种不良事件，至目前为止，本澳使用的两款疫苗均没有重大安全性问题。同时，随着本澳新冠病毒疫苗接种率的增加，每日因各种原因就诊的人士中会有相当部份是曾经接种过新冠病毒疫苗，但当中大部份出现的不适是明显与接种疫苗无关，仅是时间相关的偶合事件。应变协调中心经参考世界各地的做法，决定由即日起，只公布和疫苗接种有潜在关系的严重不良事件包括死亡事件，对有明显的医学原因能解释成因的包括死亡在内的不良事件，则只作为新冠病毒疫苖接种后不良事件评估工作小组监测分析用途，若出现不寻常的增加，才会作出公布。
应变协调中心表示，截至今（12）日下午4时，累计已接种新冠疫苗剂数为244,994剂，已接种人数共有168,333人，其中已接种1剂有90,484人，已完成接种2剂有77,849人。另外，在过去24小时，卫生局接获30宗不良事件通报，包括0宗严重不良事件，30宗轻微不良事件（22例为国药灭活疫苗，8例为BNT mRNA 疫苗）；由开始接种疫苗至今，累计978宗不良事件通报，包括3宗严重不良事件，975宗轻微不良事件。
应变协调中心呼吁，市民应在现阶段有序地预约接种疫苗，可保障自己，保护家人，并形成免疫屏障，守护澳门。