澳门特别行政区成立后的这一个十年间，社会稳步发展，特区的国际地位亦得以提高。为配合特区急速发展所带来的各种社会挑战，澳门监狱致力优化监狱服务，并强化各项狱政管理工作，坚守保护市民生命财产最后一道防线的责任。 重组架构，各司其职
为进一步提升工作效率及持续优化服务，监狱於06年10月进行架构重组，设两厅五处：两厅分别为组织、资讯及资源管理厅和监务事务厅，其中组织、资讯及资源管理厅设有人力资源处、财政及财产处及组织及资讯处，而监务事务厅设有社会援助、教育及培训处、保安及看守处；09年8月，增设公共关系及新闻处，优化及加强对外的沟通与服务。 理顺狱警队伍职程，排除不稳定因素
在06年，透过立法（第7/2006号法律），协助散位合同的狱警人员转入编制内职位，并将狱警入职学历由初中毕业提升至高中毕业；因应回归前，狱警队伍人员职程出现中层严重断层，直接影响工作分配的情况，监狱先后於05年3月及09年2月，进行了两次副警长晋升开考；09年1月，进行晋升警长开考。 电子化管理，提高效率及准确度
02年，引入囚犯管理、人事管理及财政管理等系统， 04年8月，监狱开始使用电子生物辨识系统，透过虹膜及指纹技术，更严谨、更精确地识别在囚人身份，以减低使用假证或假身份所引起的问题。 加强培训，提高狱警人员素质
监狱於2000年成立培训小组，专责狱警人员的入职及在职培训，并於06年透过架构重组，成立人力资源处，统筹管理人员事务及培训工作。回归至今，已有超过11990人次参与监狱举办的培训课程。 优化监禁设施及服务 回归后，监狱更加关注在囚人的健康问题，并加强监狱预防传染病传入的工作。从01年起，增加为在囚人注射预防破伤风、乙型肝炎及流感等疫苗，并推行在囚人新入狱措施，安排每位新入狱的在囚人进行隔离及一系列的身体检查；02年9月，於仁伯爵综合医院设立羁留病区，使有需要留院接受治疗的在囚人得到更全面的照顾；02年9月，成立由监狱社工人员组成的紧急应变小组，以便於非办时间内处理在囚人情绪、心理及家庭等方面的突发问题。 致力协助在囚人重返社会
回归前，监狱已与教育暨青年局合作，为在囚人开办小学回归教育课程；在01年更增办初中回归教育课程。回归至今，参与小学回归教育课程的在囚人共1133人次。2001年至今，参与初中回归教育课程的在囚人共377人次。高等教育课程方面，监狱鼓励及协助在囚人报读函授课程，2004年至2009年8月间，参与的在囚人共20人次，当中6人参与大学课程。监狱为在囚人开办各类配合社会发展的职业训练课程，04年至09年8月，平均每年有192人参与职业技能培训；05年11月，港澳特区政府签署「移交被判刑人的安排」协议，让合资格的在囚人可选择返回原居地服刑，有利他们日后重返社会。至09年8月，共有24名合资格的在囚人返回香港服刑；05年12月，监狱成功获英国伦敦城市行业专业学会委任为美容及制衣两种行业专业资格的考试中心，使在囚人可於狱中考取专业资格，至09年8月，共66名在囚人成功考取专业资格认可证书。 以民为本措施，达至更便民的目的
监狱於回归后，安排专责人员收及处理市民的投诉，并於06年成立公共关系小组，进一步关注与加强监狱与社区的联系；09年成立公共关系及新闻处，作更有系统及更有策略地开展各项与市民相关的工作；03年12月，监狱推出两个服务承诺项目，承诺於八个工作天内完成「申领探访许可证」及「在狱证明书」之办理。05年11月，增设「处理市民投诉之初步回覆」，承诺回覆时间为五个工作天，同时，於澳门半岛南湾大马路的中华广场8楼A座设立澳门监狱服务谘询中心，为市民提供谘询、接收投诉、办理探访许可证及证明书、约见社工、接收市民信件及补充资料的服务。 加强工作透明度
回归后，监狱不断加强工作的透明度，主动发布监狱资讯，接待来访团体，回答议员质询及回覆市民的查询等等。此外，更增设有监狱网站，方便市民可获取监狱的最新资讯。 致力协助青少年预防犯罪的教育
03年，狱中的四位青年在囚人，把自己的真实故事编写出来，在鲍思高青年服务网络的协助下收录成书「黄金屋」，并於04年拍成电影，教导青少年不要以身试法，不少学校还以此为教材。另安排青少年参观监狱设施及与在囚人对话，让他们了解犯罪后果，警惕守法。03年至09年8月，超过3500名青少年曾到访监狱。 促进社区支持在囚人重返社会
为唤起广大市民对在囚人之关注，监狱每年皆会举办在囚人手工艺品展销会，藉此向市民展示在囚人的技能，从而宣传支持在囚人士重建新生的讯息，增加广大市民对监狱的了解。08年7月，监狱邀请传媒到访，与在囚人进行制作手工艺品之工作坊，同年举办「支持在囚人士重建新生标志设计比赛」及09年的「支持在囚人士重建新生绘画比赛」，藉此带出支持在囚人重新投入社会的讯息。 加强内部沟通，提升工作效率
02年4月，监狱成立「工作改善小组」，加强与前线员工的沟通。小组成员由各部门的前线员工组成，定时进行会议，反映改善工作的意见，并直接交由领导层处理；08年11月，监狱组织了首次员工家属来访监狱活动，藉以加强员工家庭的沟通，进一步提升他们对狱警家人工作的支持。
