新型冠状病毒感染应变协调中心表示，目前本澳使用的两款新冠疫苗相关孕妇安全性的资料仍有所欠缺，因此应变协调中心会按照世界卫生组织的建议，就是除非孕妇需前往高风险地区，否则在没有紧急需求下应暂缓接种疫苗。而对于准备或正在计划生育的人士，根据国药灭活疫苗或mRNA疫苗提供的建议，相关人士均适合接种。
应变协调中心指出，一旦妇女于怀孕后感染新冠病毒的话，有可能导致流产或重症的机会增加。因此相关资料建议准备或正在计划生育的人士，更应该接种新冠疫苗，并清楚指出有关人士在接种后无须推迟生育计划或采取避孕措施。
而正处于母乳喂哺期的女性，由于本澳在接种疫苗计划早期对有关疫苗的瞭解尚未足够，故指引是建议其避免接种。但本澳的接种疫苗计划至今已启动超过8个月时间，全球对处于母乳喂哺期的女性接种疫苗的数据已逐步提升。因此，所有哺乳妇女均可接种mRNA疫苗。至于从事高风险职业或前往高风险地区的哺乳妇女，经临床评估权衡利弊和风险后，则可接种灭活疫苗或mRNA疫苗。
应变协调中心指出，不少地方的指引均清楚列明，母乳喂哺期女性在接种新冠疫苗后，建议继续母乳喂养。接种疫苗后更可避免妈妈感染新冠病毒的风险，也能避免及减少传播给婴儿的风险。