中央政府9月5日公布的《横琴粤澳深度合作区建设总体方案》，为澳门经济适度多元发展注入新动力，深合区将成为澳门融入国家发展大局的重要窗口。特区政府将持续完善横琴口岸通关措施，确保通关安全和便利。
横琴口岸首阶段的设施于2020年8月18日投入使用，目前澳门口岸区面积共6.6万平方米，出、入境各设有4条临时车道。为确保通关效率，除残障人士、孕妇、10岁或以下儿童、70岁或以上长者等需扶助者外，暂不允许旅客随车过关。
横琴口岸第二阶段建设包括有地面层永久客货车查验区域（包括客货查验车道、货车查验场和小客车随车人员验放厅）、二层交通平台后续建成部分，以及莲花大桥北侧匝道，预计将于2022年底完工，而澳门大学连接横琴口岸的通道桥正在规划筹建中，工务部门将尽快投入建设。届时，澳门口岸区面积将增加至16.7万平方米。
第三阶段则为澳门轻轨延伸至横琴口岸相关区域，目前建设工程正有序进行。
根据规划，横琴口岸永久客货车查验区域设有出、入境各9条客车车道和6条货车车道，而随车人员验放厅之出、入境大堂则各设有2条人工通道和8条合作自助查验通道。珠澳两地正准备将旅检大厅的“合作查验、一次放行”查验模式，运用到车辆检查领域，在上述区域对往来珠澳车辆实施“一站式”验放，提升跨境车辆通关效率。
“一站式”验放是指珠澳两地边检及海关共同合作，透过数据共享和执法协作，简化两地通关查验手续和提升验放效率。上述配套设施落成和新式车辆通关模式实施后，将大为优化现时车辆和随车旅客的通关情况。
永久客货车查验区域、澳门大学连接横琴口岸的通道桥等配套设施投入使用后，将为单牌车政策的逐步开放及跨境车辆的往来，提供更完善的通关配套和驾驶便利，同时也方便澳门大学科研人员经横琴口岸进出深合区、参与该区建设和发展。有关配套将进一步推动深合区生产要素的高效流动、极大程度便利在横琴生活和就业的澳门居民，为加快横琴粤澳深度合作区建设创造良好条件。