新型冠状病毒感染应变协调中心表示，澳门健康码手机应用程式推出后，澳门健康码网页版仍会开放予市民使用，其后会否一直保留则再视乎使用量和市民使用情况而定。手机应用程式的功能会较网页版更多和更方便，市民可按个人习惯选择使用。
协调中心强调，市民是否要记录行程属自愿性质，由市民自行选择，推出澳门健康码手机应用程式之目的是协助市民纪录行程和进行风险检查。但不排除日后基于澳门疫情变化及防疫需要，而要求所有人士进入特定场所时均须作行程纪录。
协调中心重申，推出应用程式的构思绝非要限制市民出行，而是协助市民纪录行程和判断风险，并及时向卫生部门报告风险和尽快求医，共同抗击疫情。