檢察院是唯一行使法律賦予的檢察職能的司法機關，職責為在法庭上代表澳門特別行政區，實行刑事訴訟，維護合法性及法律所規定的利益，以及在訴訟法律規定的情況下監察《澳門基本法》的實施。檢察院是自治的，獨立行使其職責及權限，不受任何干涉，其自治及獨立性透過該院受合法性準則及客觀準則所約束，以及其司法官僅須遵守法律所規定的指示予以保障（《司法組織綱要法》第五十五條及第五十六條）。
檢察長是檢察院的最高領導和代表，由行政長官提名或建議，報中央人民政府任命或免除職務。檢察院的其餘司法官，經檢察長提名，由行政長官任命（《司法組織綱要法》第六十二條及第10/1999號法律第十五條）。
檢察院的職權主要有（《司法組織綱要法》第五十六條）：
1）代表澳門特別行政區、澳門特別行政區公庫、無行為能力人、不確定人及失蹤人；
2）在法律規定的情況下，維護集體利益或大眾利益；
3）實行刑事訴訟；依據訴訟法律的規定領導刑事調查；監察刑事警察機關在程序上的行為；促進及合作進行預防犯罪的活動；
4）在其職責範圍內，維護法院的獨立性，並關注法院的職責是否依法履行；在具有正當性的情況下，促進法院裁判的執行；
5）依職權在法院代理勞工及其家屬，以維護彼等在社會方面的權利；
6）參與破產或無償還能力的程序以及所有涉及公共利益的程序；
7）對因當事人為對法律作出欺詐而互相勾結所導致的裁判提起上訴；
8）在法律規定的情況下，或應行政長官或立法會主席的請求，行使諮詢職能；
9）在履行職責時要求其他有職權當局提供協助；
10）行使法律賦予的其他職權。