世界衛生組織流感大流行警示維持在6級，嚴重程度為中等；本澳警示級別為第6級藍色，本地疫情為一般。目前本地甲型H1N1流感累積個案為1045例。 9月1日至2日下午，衛生局共錄得44例甲型H1N1新增確診個案。患者包括23名男性和21名女性，年齡最大59歲，最小3歲。其中2009年暑期活動飛鷹計劃軍訓營第四期2日有2名學員確診感染；位於路環的聖路濟亞中心有3名院友與1名工友確診感染；另，飛良紹街地下的少年督課中心小4班有3名學童確診感染，目前該班已停課。衛生局正在跟進各患者及密切接觸者的健康狀況。
自9月1日至2日下午，再有5名確診患者經治療後出院，另有6名確診患者正在醫院接受治療，目前大部份病人一般狀況良好及穩定。 另外，1名於 8月18日由鏡湖醫院轉往仁伯爵綜合醫院深切治療部的女性危重病人，經醫務人員全力搶救無效，於9月2日中午不治。該名中年女性患者發病之病徵為反復發燒及咽喉痛約八天，起初於急診治療無效，之後病情惡化，再次求診於鏡湖醫院；後確診為甲型H1N1流感，有雙側肺炎以及呼吸衰竭，而轉往仁伯爵綜合醫院深切治療部。患者住院後病情持續危重，神志迷糊不清，血壓不穩，呼吸衰竭嚴重，一直需要呼吸機持續使用高濃度氧氣治療、高濃度升壓藥及強心劑維持血壓，但臨床上呼吸衰竭仍不斷惡化並出現敗血症。至9月2日上午，患者病情再次轉差，經醫務人員再次對其施行心肺復甦術搶救無效，於中午12時05分不治死亡。
