自上世紀八十年代起，行政當局以俗稱“水位紙”的“水域公產範圍之臨時佔用准照”，容許部份於澳門半島內港區域經營碼頭、漁欄、貨倉等商業業務的人士，以“臨時佔用”的方式使用內港沿岸位置，並收取每平方米土地面積30澳門元年租。
隨着2015年中央政府給予澳門特區管理85平方公里海域，特區政府透過2018年生效的《海域管理綱要法》及相關行政長官批示，明確本澳土地與海域的分界，其中，內港沿岸位置納入為國有土地範圍，適用《土地法》規管。
現時於內港區內共有20個個案由水位紙轉為須依《土地法》管理，基於對現有個案狀況影響最少為前提，行政當局採用《土地法》中性質相近的“臨時佔用准照”對相關個案進行管理。考慮到相關個案的業務性質，行政當局在《土地法》的“佔用准照每年繳納的費用表”中，於“商業及服務業”和“工業”項目中間新增“碼頭”項目，年費金額取兩者的平均值，定為每平方米土地面積年費980澳門元，並透過行政長官批示公佈。
特區政府必須公平依法規管，但考慮到讓准照持有人能適應及過渡，故採取了相應措施：
1. 由2018年《海域管理綱要法》生效後至新佔用准照發出前，按每平方米土地面積收取30澳門元年費；
2. 在發出有關准照後以漸進模式徵收年費，首年30%、第二年60%、第三年90%，從第四年起徵收全額年費。
為讓相關人士明瞭有關情況，政府相關部門已與臨時准照持有人舉行會議說明情況。另外，內港貨運碼頭業務自2022年9月作出調整後，內港一帶通行的大型貨櫃車輛明顯減少，有效紓緩該區交通壓力，達到預期效果。為方便業界，現階段仍維持容許散貨貨櫃於碼頭範圍內拆櫃及卸貨，業界可在符合安全規定的情況下選擇合適的操作方式。