因應接獲廣東省衛生部門通報，廣州、珠海兩市在當地活禽市場外環境檢測出H7N9禽流感核酸陽性，民政總署、衛生局及海關於一月六日下午舉行緊急內部會議，並於其後聯合召開記者會介紹禽流感的應對工作，包括加強防控措施及保持與鄰近地區部門聯繫，同時呼籲市民提高警覺，共同做好預防禽流感的工作。
根據衛生局接獲廣東省衛生和計劃生育委員會通報，廣州市、珠海疾控中心分別在廣州市增城市荔城街興發活禽市場及珠海市來自斗門區井岸鎮南潮活禽市場的常規監測中，在市場外環境檢出3份和1份標本H7N9禽流感核酸陽性，經對標本進行覆核結果一致；同時，廣東亦再新增確診2例人感染甲型H7N9禽流感病例，患者分別居於廣州佛山市南海區及陽江陽東縣，兩名患者目前病情危重。
民政總署管理委員會代主席黃有力於記者會上表示，接獲珠海檢疫部門通報，斗門出入境檢驗檢疫局已經因應事件即時加強轄區內所有供澳家禽養殖場緊急H7監測工作，一月五日當日共採取1440份樣本並於當晚完成樣本檢測，結果全部為陰性。有關當局亦要求所有供澳活禽運輸車輛不得經過斗門井岸，必須繞道前往澳門；禁止供澳活禽養殖場從業人員和運輸工具前往珠海市所有活禽批發市場；同時加強了進出供澳活禽養殖場人員和運輸工具的防疫消毒。
民署管委會委員吳秀虹表示，已即時向內地相關部門了解情況，得悉檢出問題樣本的活禽市場13公里範圍內並沒有註冊養殖場供應家禽與本澳。現時內地供澳禽鳥必須通過H7禽流感檢測，合格後方可供應本澳銷售，目前檢測樣本並沒出現異常。現時民署仍持續對本澳街市三鳥檔進行多項監督措施，包括：所有零售活家禽場所只許出售已屠宰之家禽，街市三鳥檔內之活禽會於每晚7時半前進行屠宰，禁止活禽留置過夜及將活禽帶離街市；街市三鳥檔每隔十五日須進行徹底清潔消毒，街市稽查人員將進行監督；街市稽查人員會密切留意禽鳥從業員之健康情況，如有身體不適會勸喻其盡早就醫；民署會按街市禽鳥從業員之意願，由衛生當局為其免費注射流感疫苗等。
為了防範禽流感，民署每月亦會定期派員到零售活家禽場所收集禽鳥糞便、和環境樣本作禽流感病毒化驗。2013年民署在全澳零售活家禽場所抽取糞便樣本1022個及環境樣本546個，所有樣本化驗結果皆為陰性；亦收集了合共764隻野鳥屍體，經過禽流感病毒化驗後未有發現任何陽性反應。另外，海關關檢處處長黃偉文亦表示，海關會一如概往在本澳各口岸及邊境堵截非法進口的禽類產品，並已與民署商訂合作機制，一旦截獲會即時送交民署作跟進檢測。
衛生局局長李展潤表示，由去年春天至今，人感染甲型H7N9禽流感病例在各地，包括廣東省零星出現，該病毒在禽鳥中持續存在，而感染病毒的禽鳥無症狀，因此防控工作較困難。根據目前的情況，不排除澳門鄰近地區或澳門出現零星個案。
為防範人感染H7N9禽流感，衛生局會加強與民政總署等相關部門聯繫和合作，以便民政總署採取適當的禽鳥管理措施；與世界衛生組織及鄰近地區衛生部門保持密切聯繫；加強監測，及早發現病人：向醫護人員發出指引，對疑似病例進行檢測。直至目前，共檢測38個樣本，其中12月後共檢測14個樣本，均為陰性；向不同性質機構、政府部門、業界發出預防指引及進行講解會；重新檢視現有隔離設施及設備；衛生局公共衛生化驗所已準備了1200份診斷試劑，若出現懷疑病人，可在6小時內作出診斷；儲備超過18萬人治療所需的抗流感病毒藥物，以及可供衛生局、其他政府部門及非牟利機構大量使用逾3個月的消耗性防護物資等；持續在口岸進行測溫工作；持續透過各種媒體對市民進行宣傳教育工作。
衛生局亦呼籲巿民，避免前往有出現甲型H7N9禽流感疫情地區的街巿、農場等有售賣或展示禽鳥的地方；切勿購買及偷帶未經檢疫的家禽及其產品回澳門；避免接觸禽鳥及其分泌物、排泄物；如有接觸，應立即洗手；切勿進食未經徹底煮熟的禽鳥肉、內臟、血製品及蛋等；注意個人衛生，經常洗手；如出現發熱、咳嗽、呼吸困難等症狀，應戴上口罩，儘快就醫，並向醫生詳述旅行史及動物接觸史。
此外，澳門已進入季節性流感的高峰期，仁伯爵綜合醫院成人流感樣疾病的就診人數已超平時的50%，衛生局呼籲合資格免費接種而尚未接種的人士盡快接種。
