衛生局關注鄰近地區傳媒報道一名兒童流感併發腦炎死亡個案，呼籲居民注意及防範流感，尚未接種流感疫苗的居民應盡快接種。
為擴大社區免疫屏障，更大程度保障居民健康及更好地利用現有餘下約3萬多劑流感疫苗，衛生局已於2017年1月1日起擴展至所有澳門居民免費接種2016-2017年度流感疫苗，接種者年齡須為6個月以上。自1月1日開放全澳居民免費接種後，至今已有2,369名居民前往接種，目前2016-2017流感疫苗總接種數為87,257人，較去年同期的80,286人增加約7,000人。
為方便居民於流感高峰期前能盡早接種流感疫苗，衛生局特於明後天（即1月7日及8日、周六日）早上9時至下午1時，開放全澳衛生中心及路環石排灣臨時衛生站提供接種服務。其他一般日子的接種地點除衛生中心外，亦包括仁伯爵綜合醫院接種站、鏡湖醫院接種站、科大醫院門診及工人醫療所。欲接種的居民需現場出示澳門居民身份證、衛生局使用者卡(俗稱金卡)及流感疫苗接種記錄卡(如有)，經醫護人員現場評估沒有禁忌症即可接種流感疫苗。接種不需要預約，無衛生局使用者卡人士請聯絡住址所屬衛生中心辦理，流感疫苗接種記錄卡在接種後將即時發給接種者。
衛生局表示，本澳2016年12月份（第49周至53周）流感樣病例數與2015年同期相約。根據監測資料，2016年12月公共衛生化驗所在流感樣病人中檢出流感病毒的陽性率平均為6.2%，而檢出的流感病毒均為甲型流感病毒（H3型）。同時，醫院定點監測資料顯示本澳2016年12月流感樣病例數與2015年同期相約，其中成人急診因流感樣病例就診人次占總就診人次的比例，平均為每千人次中的20人次，較2015年12月的14人次增加；而兒科急診的比例平均為98人次，較2015年12月的103人次稍減少。2016年12月共錄得3宗群集性流感樣疾病事件，較2015年12月的4宗減少，2宗發生在教育機構，1宗發生在特殊托管機構。2016年12月共錄得1例流感伴肺炎病例，患者為96歲男性，有長期疾患，入院時情況穩定，無需使用呼吸機，現已出院。
本澳即將進入春季流感高峰，而近年流感高峰較過往嚴重， 衛生局在2016全年共錄得36名流感併肺炎重症病例報告，當中近九成重症病患未有接種當季的流感疫苗。澳門的流感傳播高峰一般在每年1至3月出現，6至8月會有另一個小高峰，由於流感疫苗接種後一般要至少2至3星期後才能產生足夠抗體以達到保護作用，衛生局再次呼籲高危人士應盡快接種，特別是孕婦、幼兒、長者及慢性病人等較易出現流感併發症的人群，每年應在流感疫苗接種計劃開始後及流感高峰前提早接種流感疫苗。
本年度衛生局採用的流感疫苗為四價流感疫苗，可以預防兩種甲型和兩種乙型流感，與三價流感疫苗比較，可以提供對抗多一種乙型流感的額外保護，疫苗針對的是2017年1月至8月季節性流感。衛生局提醒，若在2016年9月後已接種了流感疫苗，現在不需要重複接種（9歲以下首次接種的幼兒需要接種第二劑除外）；若在2016年9月後未曾接種流感疫苗的高危人士，應盡早接種。