2017年12月14日，粵澳合作中醫藥科技產業園通過廣東省科技廳嚴格的形式審查、專家評審等程序，正式獲得廣東省粵港澳臺科技企業孵化器認定，成為廣東省首批4家粵港澳臺科技企業孵化器單位之一。
為貫徹落實第十二屆全國人民代表大會第五次會議政府工作報告中提出“粵港澳大灣區”規劃及粵港澳三方共同簽署的《深化粵港澳合作推進大灣區建設框架協議》精神，鼓勵廣東省科技企業孵化器深化粵港澳臺合作，更好地對接港澳臺科技創新創業資源，推動粵港澳大灣區發展，廣東省科技廳於2017年10月組織省內孵化器進行申報，申報中對孵化器在孵化港澳臺項目方面的服務及成效、入孵港澳臺企業數量及成功孵化案例等方面均設定了一定要求。
產業園作為《粵澳合作框架協議》下首個落地項目，為深化粵澳合作，促進澳門與國內外中醫藥產業的融合發展，自2015年來，產業園按照國家級孵化器的建設與運營標準，在加快孵化器硬件載體建設的同時，不斷完善孵化器運營管理體系，提升孵化器的企業培育能力。為此，產業園建立了專門的企業服務部門，為入園企業提供商事登記、專項基金申報、專利申請、高新認定等專業服務，制定並實施了《粵澳合作中醫藥科技產業園孵化器管理辦法（試行）》，定期對入園企業運營情況進行統計分析，加強對入園企業後續考核與管理等。為解決入園中小企業融資難問題，產業園與橫琴金融投資有限公司正在探索合作設立園區創新創業引導基金。在營造園區創新創業氛圍方面，產業園組織了中醫藥政策與技術沙龍、高新技術企業認定、企業專利申報等10多次企業培訓活動。
此次產業園獲得廣東省粵港澳臺科技企業孵化器認定，為產業園今後申報國家級孵化器奠定了良好的基礎。此外，廣東省相關部門後續也將出臺相關政策扶持粵港澳臺科技企業孵化器的發展，將會進一步促進澳門創新創業資源與產業園創業孵化體系的深入對接。