日本腦炎是由日本腦炎病毒所引起的急性傳染病，這種病毒會經由蚊叮咬而傳播給人類。感染日本腦炎的患者大部分是沒有症狀的，少部分的病患會有頭痛、發燒或無菌性腦膜炎等症狀，嚴重者則會出現頭痛、高燒、痙攣、抽搐或昏迷等症狀，最後可能導致神經、精神性後遺症或死亡。日本腦炎主要流行於內地(西部以外地區)、台灣地區、東亞(如日本、朝鮮、韓國)、東南亞、南亞(印度、巴基斯坦、斯里蘭卡、尼泊爾、不丹、馬尔代夫等)、南太平洋等地的郊外及農村，特別是養豬場附近地方。
為預防居民感染日本腦炎，內地、中國台灣及日本、朝鮮、韓國等國家和地區均將日本腦炎疫苗納入常規的防疫接種計劃內。由於並沒有養豬場，傳播媒介三帶喙庫蚊亦不多見，日本腦炎在澳門十分罕見，在過去10年均未錄得個案，故澳門暫不考慮將其納入到常規的防疫接種計劃內，但一直有採購該疫苗供前往上述國家和地區長期停留的人士接種，並通過高等教育輔助辦公室向前往外地就學的大學生發放有關指引。
前往上述國家或地區就學或其他原因長期停留的澳門居民，由於沒有上述疾病的抗體，在當地長期居住及生活，有比當地人更高的感染風險。為預防感染該疾病，衛生局建議前往上述國家或地區就學或其他原因長期停留的人士，尤其居住、上學地方位處郊區、農村或需要經常到郊區、農村活動者，在當地或前往當地前接種日本腦炎疫苗，並注意防止被蚊叮咬。而對前往流行地區和國家短暫停留的人士則建議注意採取防蚊措施。
衛生局目前採用的日本腦炎疫苗為減毒活疫苗，適用於9個月及以上人士，只需接種一劑。有需要接種的市民請前往居住所屬的衛生中心要求安排接種。由於日本腦炎疫苗為前往外地的人士才需要，根據防疫接種行政法規規定，該疫苗需付費接種。如有任何疑問，可致電傳染病熱線28700800查詢。