衛生局關注到有手機討論群組流傳對孕婦接種流感疫苗的安全性存有疑慮，導致有醫護人員錯誤理解孕婦不適合接種流感疫苗。衛生局特此澄清，現時已有很多證據充分顯示孕婦接種滅活流感疫苗是安全有效的，有關傳言的資訊是2006年舊資訊，由2012年開始世界衛生組織已發佈最新建議，孕婦應納入流感疫苗的最優先接種對象。
世界衛生組織早於2005年的立場文件開始提出孕婦接種流感疫苗建議，而其轄下全球疫苗安全諮詢委員會於2006年的網上資料顯示，委員會曾在2003年審視滅活流感疫苗的安全性資料，提出尚未有妊娠期接種流感疫苗安全性的相關資料，建議需評估對於孕婦及其嬰兒的風險及利益，當時疫苗生產商和國家衛生部門傾向於不主張孕婦接種。然而，多年來隨著越來越多的研究數據證實孕婦接種滅活流感疫苗非常安全有效，世界衛生組織早於2012年已明確表示，高度建議孕婦接種流感疫苗，強調沒有證據顯示孕婦接種滅活流感疫苗（即使在妊娠第一期）會對胎兒造成不良影響。
更重要的是，孕婦在懷孕期間的生理狀態會出現改變，一旦感染流感，出現肺炎、腦炎、心肌炎等嚴重併發症，以及住院和死亡的風險均較一般成人高。孕婦接種流感疫苗可減少孕婦及嬰兒患上急性呼吸道感染的機會，降低因流感出現心肺併發症及住院的風險及降低胎兒死亡風險。同時，通過母親孕期接種流感疫苗，以減低流感病毒傳播至嬰幼兒，可使不能接種疫苗的6個月以下嬰兒獲得保護。現時美國、澳洲、歐洲先進國家，以及鄰近的香港、台灣地區均建議孕婦接種流感疫苗。本澳由2015年9月開始將孕婦加入流感疫苗的建議免費接種對象，並無發現有不良危害，而衛生局一直採購的流感疫苗均是滅活疫苗，而不是減毒活疫苗，滅活流感疫苗適用於孕婦。
衛生局「2018-2019年度流感疫苗免費接種計劃」已於9月24日開始，衛生局今年訂購了15萬劑2018-2019年四價滅活流感疫苗，現階段優先予高危人士免費接種，截至9月28日已為3,840人接種，比去年同期3,006人多。為方便居民，各衛生中心及衛生站除延長週一至五的流感疫苗接種服務時間至晚上8時，並於國慶假期（10月1及2日）早上9時至中午1時開放接種流感疫苗。澳門的流感高峰期一般在每年的1至3月出現，比溫帶地區（如中國北方和日本）較遲，衛生局呼籲老人、兒童、孕婦、肥胖人士及慢性病人等感染流感後較易出現併發症的高危人士及經常接觸高危人士者應儘早接種疫苗，詳情可瀏覽衛生局網頁www.ssm.gov.mo/vaccine。