就最近有醫療中心被揭違法存放疫苗，有議員提出建議政府允許私家醫生可自行存放疫苗的意見，衛生局強調，澳門現時嚴格按照世界衛生組織的相關指引採取高規格監督疫苗的儲存和供應，旨在保障兒童及居民健康，將疫苗因冷鏈出現問題的機會降至最低風險。
衛生局強調，特區政府十分重視澳門居民健康和生命安全，一直致力向居民提供全面的防疫接種服務。根據現行「澳門特區防疫接種計劃」，包括預防13種疾病的疫苗，其中除區內國家／地區常包括的預防結核病、乙型肝炎、百日咳、白喉、破傷風、小兒麻痺症、麻疹、德國麻疹、腮腺炎等疾病的疫苗外，還包括預防肺炎鏈球菌、流感嗜血桿菌(引起幼兒腦膜炎)、水痘和子宮頸癌疫苗，而18歲以下的澳門居民可得到免費接種；澳門居民中的育齡婦女可免費接種麻疹、德國麻疹、腮腺炎混合疫苗，乙型肝炎高危成人亦可得到相關疫苗的免費接種。基本上，按衛生局建議需要接種疫苗的人士，現時可在衛生局轄下10間衛生中心及衛生站、及衛生局設在鏡湖醫院的接種站接種，疫苗用於澳門居民及少部分已獲准長期在澳生活的非本地兒童，其他非本地人士即使付費亦不會得到這些疫苗的接種。
目前，澳門私人巿場疫苗的需求，主要來自非本地居民或旅客，或「澳門特區防疫接種計劃」以外的幼兒及成人疫苗，如18歲以上人士欲自費接種子宮頸癌疫苗，或家長希望為幼兒自費接種輪狀病毒疫苗。此等有需要人士仍可以到私人醫療機構接種，按照法例具備條件的私家醫院及註冊藥房可存放疫苗。
衛生局強調疫苗是對溫度十分敏感的產品，若在生產、運輸、儲存到使用的任何環節受到不適當的溫度影響，都會影響到使用的效果和安全性，而這些均難以從疫苗外觀上察覺。同時，由於疫苗的作用是預防，接種失效的疫苗並不能如一般的藥物那樣立即發現無效，而是在數年或數十年接觸到有關病原體後才會發現。根據國際指引，為確保疫苗的品質，醫療場所疫苗冷鏈的管理及審核要求包括：1) 儲存疫苗的場所必須具備足夠後備電力，含緊急供電設備、自動發電機、不斷電系統以應付任何緊急而不可抗因素包括惡劣天氣或災難引起的斷電情況；2) 冷鏈設備能穩定將溫度維持2-8°C；3) 設有高低溫度準確性的監控裝置（包括溫度持續紀錄裝置、高低溫度警報器、冷凍監視等）；4) 設備需定期維修及保養；5) 疫苗管理人員須有足夠訓練，接種單位也須具備對疫苗冷鏈事故緊急應變處理及嚴重不良反應與異常事件處理的能力。
為確保達到上述要求，衛生局採購的疫苗均由藥廠倉庫直接運抵衛生局疫苗倉庫，在接受每一批疫苗時衛生局都會檢查疫苗在運輸過程每一時刻的溫度；疫苗倉庫和各接種點的疫苗雪櫃設有24小時溫度監察和警報系統，而疫苗由倉庫送往各接種點時，亦會在疫苗保溫箱內放置溫度監測裝置。與鄰近地區相比，基於澳門地理的獨特性，有相當部分地區屬低窪地區，每年颱風季節均會出現水浸及部分地區停電，為確保疫苗品質，現時衛生局供應疫苗的接種點均已設有後備電力裝置，及將疫苗雪櫃置放在較高樓層，並設有實時溫度超出警報等措施。過去部分接種點在未有後備電力裝置時，亦曾出現長時間停電，衛生局經評估後便會將確定受影響的疫苗全數銷毀，以確保供應疫苗的質量。目前所見，一般私家診所未具有此方面的設備條件，可以確保疫苗在儲存能達到同等規範。
就有意見表示鄰近地區，如香港亦有私家醫生儲存疫苗供應，衛生局表示，根據香港衛生署公佈的資料，近年的例行巡查都有發現診所疫苗儲存溫度超出建議範圍的情況，亦出現多宗有關私家診所存放疫苗不當的新聞，揭露出相關問題的隱患，包括有診所雪櫃溫度有多於30日偏離建議的儲存溫度，令疫苗失效，亦有診所為至少20人錯誤注射過期的疫苗。而根據衛生局對本澳私人醫療場所的巡查記錄，曾發現診所存放疫苗的雪櫃內同時儲存食品，亦曾發現有診所存放過期疫苗。澳門多年來一直由政府負責兒童的防疫接種，由於有完善的記錄，所以可追溯到30年前在本澳出生及在本澳完成小學教育的居民 ，在衛生局的電子衛生訊息系統中的相應記錄。
另外，對於有議員表示注射已失效的疫苗雖起不到刺激身體產生抗體的作用，但不能因而推測會對人體產生嚴重副作用的說法，衛生局不認同有關說法，強調如有兒童接種了失效疫苗，雖然未必即時對人體產生嚴重副作用，但因為誤以為已具有相應疾病的免疫力而沒有採取其他預防措施，增加感染相關傳染病的風險，有機會導致嚴重併發症及死亡，後果可以很嚴重。更重要的是，失效疫苗對人群失去保護效應，有可能造成嚴重的公共衛生危機，破壞澳門一直以來行之有效的免疫屏障，衝擊澳門的公共衛生防禦體系，增加澳門爆發傳染病的風險。而部份疫苗的作用是預防癌症的發生，疫苗失效將導致個別癌症發生率上升。而更為嚴重的是，這些疫苗失效的情況經常只能在數年或數十年後才被發現。另一方面，由政府全面統籌疫苗接種，有助建立全澳市民健康數據，對制定地區公共衛生政策有很大幫助。此外，若採用一瓶多劑量疫苗，打開後儲存温度不適當，亦可造成細菌感染等嚴重後果。
衛生局強調，不同疫苗對溫度有不同的敏感度，舉例如減毒活疫苗比滅活疫苗對溫度更不穩定，如麻疹疫苗對熱非常敏感，另外一些滅活疫苗則對冰凍敏感，如乙型肝炎疫苗；儲存疫苗的溫度太熱或太冷都有機會破壞疫苗，令疫苗失效，失效疫苗不應該被使用。衛生局極為重視疫苗的安全性，衛生局將維持較高規範監督疫苗存放以保障居民健康，確實做好本澳疫苗品質的嚴格把關，令居民放心接種疫苗。