應變協調中心稱，在口岸的檢疫分為兩部分，即醫學檢查和醫學觀察。
對一些入境前14日曾到過中國高發地區的人士，或是多次不正常往返珠澳的澳門居民，會採取醫學檢查，目前在澳門所有口岸都實施此措施，需要接受醫學檢查的人士會被轉送到綜藝舘或氹仔碼頭作醫學檢查。至於到過中國以外的國家和地區的人士，則要作醫學觀察。
應變協調中心表示，醫學檢查和醫學觀察是根據疾病傳播的風險而定，即早前湖北省是高風險傳播地區，故當時來自湖北的居民或曾到過湖北的澳門居民入境時，都要出示無感染新冠肺炎的健康證明。
現在的疫情在中國以外的國家和地區爆發，因此對從中國以外的國家和地區回澳人士採取高規格的醫學檢測、採取14日醫學觀察，中國内地疫情開始放緩，則採取醫學檢查。