新型冠狀病毒應變協調中心(下稱應變協調中心)表示，因應廣州和佛山疫情，衛生局將向14天內曾到過廣州或佛山的人士發出短信，要求他們在指定期間內主動接受新冠病毒核酸檢測，如未能在指定期間接受檢測，他們的健康碼會變成黃色，直至完成檢測且結果為陰性，方可轉為綠碼。
有關措施在6月7日9時起實施，衛生局將陸續向有關人士發出短信，收到短信者可根據短信指示的鏈接預約免費核酸檢測，在指定期間內進行核酸檢測。有關核酸檢測結果不可用於通關。若市民有通關需要，則應使用一般市民使用的衛生局的核酸檢測預約系統預約核酸檢測，又或者在廣東省內可將結果上載粵康碼的檢測機構內檢測。
另外，應變協調中心已作出公佈，今(6)日下午6時起，14天內曾去廣州番禺區的人士，須接受14天醫學觀察。應變協調中心表示，廣州南站位於番禺區內，若從其他地方乘高鐵途經廣州南站但沒有出站者不視為去過番禺區，不必申報去過番禺，不需接受14天醫學觀察。