至2009年7月17日爲止，本澳共處現102宗甲型H1N1流感確診個案，其中輸入個案66例，本地個案36例。首例個案於2009年6月18日確診。在輸入個案中，較多來自香港(10例)，澳洲(9例)、泰國(8例)、菲律賓(7例)、印尼(7例)、英國(4例)、希臘(4例)。 在所有個案中，有9人(8.8%)是被口岸醫療輔助隊發現後，轉至仁伯爵綜合醫院就診的；60人(58.8%)因不適而自行到醫療機構就診；另有33人(32.4%)是在衛生局跟進密切接觸者時發現的。其中，共有男性患者54人，女性患者 48人，年齡介於4個月至63歲，當中輸入個案以15至29歲的青年最多，其次是5-14歲兒童，兩者相加占全部輸入個案的82%。而在本地個案當中，各年齡層的患者均有，又以小於5歲者最多 (10人, 占本地個案28%)。 直至目前，大部分個案的潛伏期均很短，約只是1天至5天。病人的症狀以發熱最常見（94%），80%有咳嗽，52%有咽痛，39%有流涕，且病情均不嚴重。至今無人出現併發症，且大部分個案患者亦能在7天內痊癒。在有明確傳染源的個案中，傳染大部分發生在家庭；目前累計有10個家庭內傳播個案，其中一家庭共有6名成員患病。 另外，本地至今未錄得工作同事間發生傳播，或患者同機旅客被傳染的案例。
學校內傳播在其他地區是一個重要的疫症傳播途徑，在本澳卻未見一樣；主因是本澳出現本地傳播的時間較遲，疫情出現在大部分學校已放假，暑期班亦已根據協調中心的指令停辦。故此，只有兩個傳播案例發生在學校，包括一個在蔡高中學(停辦暑假班要求下逹前半日的暑期班)，以及近日聖羅撒女子中學的暑期加強班。另外，有2間托兒所發生了傳播。 雖然至今亦錄得2名醫務人員發病個案，但兩人均是被家中在托兒所受托的兒童傳染，顯示醫務人員已有足夠的訓練和保護，在工作中受感染的機會不大。只有一名衛生局的技術人員在工作中受到感染。值得留意的是，2個群集發生的輸人性個案，是在前往外地參加體育比賽中發生，包括前往希臘雅典參加兒童奧運會4名隊員和近日前往新加玻參加擊劍公開比賽的2名隊員。 雖然目前在本澳發現的新流感個案都不嚴重，但世界其他地區的經驗表明，當病例增加時，會出現嚴重個案甚至死亡個案，因此，衛生局呼籲巿民切勿掉以輕心。根據世界衛生組織指引，衛生局亦已將工作的重點從防止傳播轉移到妥善診治病人上，將逐步對患者實施家居治療，衛生局將根據患者的具體情況判斷患者是否適宜進行家居治療，並透過電話家訪對患者進行跟蹤觀察。此舉並非表示衛生局不重視病人的治療，而是希望騰出更多的資源，集中到發現和治療危重或有危險因素的病人身上，並將加速對甲型H1N1流感疫苗與普通流感疫苗的採購工作，及時為高危人士免費注射肺炎鏈球菌。 因應早前估計本澳從外採購之疫苗可能於九月份抵澳一事，衛生局負責人表示：本澳已向全世界三大的疫苗公司詢價，只有意大利的疫苗公司能最早在11月提供20萬劑疫苗，且相信其疫苗實效應較爲可靠。據報道，香港方面的疫苗需要在12月份才能到貨。現時，衛生局正努力向其他採購地採購疫苗。另外，世界衛生組織總幹事陳馮富珍亦曾質疑比預期快速生産的疫苗的功效，認爲有疫苗供應不等於這些疫苗已證實安全。
