教育暨青年局一直密切關注甲型H1N1流感疫情的發展趨勢，與衛生局、體育發展局等部門，以及學校、持續教育機構、私立補充教學輔助中心和青年社團等保持著緊密的溝通與合作，制定了各項防禦及應變措施，做好準備來面對可能出現的疫情。 為了全力做好各項校園防疫的準備工作，截止6月12日為止，本局共撥出1百3拾多萬元，資助39間學校添置測溫等衛生設備和消毒用品；本局與衛生局緊密合作，已召集學校負責人舉行了多次工作會議，步處防疫抗疫措施；同時，已製作好各項指引和相關的資料，包括學校預防甲型H1N1流感事件處理指引、校園危機管理小組一般運作、學校停課預案、學生往外地交流活動需注意事項、防禦甲型H1N1流感在校園擴散指引( 學校負責人篇、家長篇、教師篇、學生篇，學生輔導員篇)，指導和協助校方按實際情況，擬定停課前後的應變方案及日後復課的安排、建議學校強化與家長的溝通機制、並加強對師生和家長的衛生宣傳教育工作等。 同時，本局還制定了防禦甲型H1N1流感擴散指引( 補習社篇、持續教育機構篇)，並寄送予相關機構；亦向各青年社團派發有關「指引」，並派員到部分補習社、有較多人出入的青年社團、青年中心、本局轄下及受資助的自修室等，監督各項防疫措施的準備情況。 針對目前的情況，本局對暑期活動各個班別和各項活動地點的場地、設施、通風系統等進行了風險評估，制訂了一系列的注意事項、措施及指引，並致函敦促各個協辦單位執行相關規定，同時亦設立了學生請假和缺席機制，以及取消活動或部份班別的通知機制和預案，以便在有需要時按既定的計劃做出相應的安排，並第一時間通知家長和參加的青少年。 一旦本澳出現本土病例，流感預警級別提升至第六級時，教青局會在評估整體風險後，按照流感應變協調中心的決定，考慮全澳中、小、幼學校停課和停止暑期活動。倘若宣佈學校停課，本局呼籲學校積極配合並貫徹執行既定的停課預案，同時處理好學生學業、教職員工工作安排、校園安全與衛生以及相關信息公佈等事宜，學校亦可與教青局或流感應變協調中心直接溝通協商。
