粵澳新通道（青茂口岸）既是粵澳合作重點項目，亦是澳門重要民生工程。口岸將實行24小時通關，通關承載力為每日約20萬人次，通關後將進一步便利兩地人員跨境往來。
粵澳新通道（青茂口岸）是繼港珠澳大橋珠澳口岸和新橫琴口岸後，又一個實施“合作查驗，一次放行”通關模式的口岸。新的口岸距離關閘口岸約800米，功能定位為輔助及分流關閘口岸人流，以自助通關為主，設有100條合作快捷查驗通道（又稱合作自助查驗通道，出入境各50條）及4條人工查驗通道（出入境各2條），不設車輛通道。
為配合粵澳新通道(青茂口岸)“合作查驗，一次放行”通關模式，海關對出境人士的檢查流程作出調整，關檢工作提前在出境證件查驗手續前進行，出境旅客完成海關查驗後再辦理證件查驗手續。市民或旅客在出境時需先通過關檢區接受檢查，期間應持有合法的出入境證件，受檢人士須按海關人員指示接受檢查。市民或旅客通過關檢區後，再到合作查驗通道辦理出境手續，才視為完成整個出境流程。
入境關檢方面則與現時的通關模式相同，即市民或旅客首先接受證件查驗，然後通過澳門海關入境關檢區域。
為了增加通關效率，減少與市民或旅客所攜帶物品的接觸，海關投入高科技關檢設備執行關檢工作，以非入侵方式對旅客及其行李進行檢查，運用智能審圖技術，提升通關便利水平。
衛生檢疫方面，將會採用和横琴口岸相似的模式，在出境方接受體温和輻射檢測外，在疫情期間，在通過自助閘機或人工櫃台接受出入境查驗後，須到衛生檢疫櫃台檢查健康碼和核酸檢測報告。由於出入境之間沒有緩衝地帶，為使出入境人士充分利用合作查驗的便利，出入境人士須確保持有效的新冠病毒核酸陰性檢測報告，出境往珠海的人士須提早以澳門健康碼轉碼生成粵康碼通關憑證，而入境到澳門人士亦應提早以粵康碼通關憑證轉碼生成澳門健康碼。為減少在出入境大樓因網絡更換引起的上網問題，建議出入境人士在健康碼或通關憑證生成後截圖保存。
2012年5月粵澳兩地政府正式簽署《粵澳新通道項目合作框架協議》，在中央政府的高度重視和大力支持下，粵澳新通道項目在2017年4月獲國務院正式批復同意設立口岸。項目主體工程於2018年初正式動工，澳門邊檢大樓已於今年5月初完成建設。