新型冠狀病毒感染應變協調中心表示，所有醫學觀察酒店在投入使用前，衛生局都會派人員，包括工程師到酒店觀察整體場所佈局、通風系統是否適合作為醫學觀察酒店的使用等。此外，還會對醫觀酒店制作指引及進行培訓，其中，指引會針對幾方面，包括要求場所的通風確保鮮風量和抽風量；酒店員工有不接觸的原則或減少接觸的原則；所有工作人員在場所工作都受到規範，執行不同的職務需要穿著不同的裝備；保安人員方面也有訂明其職責、工作注意事項，包括負責防止醫學觀察人士離開房間，其在執行職務時一定要確保正確穿戴防護裝備，減少與醫學觀察人士接觸等。
此外，指引也就環境衛生方面作出規定，包括如何處理場所的垃圾、如何做好環境的清潔消毒。膳食供應方面也有規範，要求食物需按食品安全指引作處理，以不接觸式的原則派發，因此，食物是不會直接交給醫學觀察人士，而是放在房間外的枱或椅子上，再通知醫學觀察人士自行領取食物。同時要求場所負責人要按照指引執行和督促員工去認真落實。