10月4日起高等院校恢復面授教學活動，非高等教育學校恢復上課。教育及青年發展局在記者會上介紹了復課指引：
1. 學校必須嚴格執行教青局及衛生局的各項防疫指引，復課前必須做好校園清潔消毒工作，師生進入校園時必須佩戴口罩、如實填寫健康申報、注意個人衛生及嚴格測溫等。
2. 紅黃碼區的師生不應進入校園。
3. 受到通關措施影響未能回澳之跨境學生、紅黃碼區的人士，以及個別情況申請不回校上課的學生，學校按實際情況和校本化措施，優先實施錄播課堂，或於條件較好的情況才選擇直播課堂，配合寄送學習材料（例如PPT、講義等）、遙距佈置一周的在家學習計劃等，彈性地安排上述學生在家學習；同時，學生回校後，學校提供適當的輔導等措施，如保底班、督課等作跟進。
4. 復課首周家長可因應個別情況，自行決定是否讓就讀子女回校上學，並向學校申報。
5. 復課初期之課堂教學原則應以關顧學生的學習適應及鞏固知識為主，整體採“宜鬆不宜緊”的策略，復課初期評核亦應彈性和視乎實際情況酌情處理，不安排測驗或考試等方式的評核。
6. 學校暫停一切體育活動及餘暇活動，直至另行通知。學校應暫停或調整集體活動的方式，避免進行不佩戴口罩的活動，如運動、歌唱、表演、樂器吹奏等課堂。
另外，由10月25日起，高等院校教職員工和大學生、非高等教育學校的教職員工進入校園須出示至少已接種第一劑疫苗的證明，或出示7天核檢陰性證明，而持有衛生局發出“不適合接種新型冠狀病毒疫苗醫生評估證明書”的師生可豁免有關核酸檢測費用。